德國(guó)Peter F. Stadler教授和比利時(shí)Rui Diogo博士訪問水生所
應(yīng)水生所魚類系統(tǒng)發(fā)育與生物地理學(xué)科組的邀請(qǐng),德國(guó)University of Leipzig生物信息學(xué)研究所Peter F. Stadler教授和比利時(shí)University of Liege功能與進(jìn)化形態(tài)學(xué)實(shí)驗(yàn)室Rui Diogo博士于2006年3月15-19日訪問了水生所,并分別作了題為“Genome-wide annotation of (structured) non-coding RNAs”和“Comparative anatomy, phylogeny and evolution of actinopterygians: new insights”的學(xué)術(shù)報(bào)告。
1965年出生的Stadler教授1986-1990年間獲得維也納大學(xué)化學(xué)、天文學(xué)和物理學(xué)本科學(xué)位;并在此期間先后于1988年和1990年獲維也納大學(xué)化學(xué)碩士和博士學(xué)位;1990-1991年間在德國(guó)馬普生物物理與化學(xué)研究所作博士后研究;1991-1997年間在維也納大學(xué)任助理教授;1997-2002年間任維也納大學(xué)副教授;2002年至今任德國(guó)萊比錫大學(xué)終身教授。目前主要從事基因組學(xué)、RNA基因組學(xué)(RNomics)和蛋白質(zhì)基因組學(xué)的研究工作。研究興趣廣泛的Stadler教授還同時(shí)從事數(shù)學(xué)、化學(xué)和生物物理學(xué)方面的相關(guān)研究。其中在我所作的報(bào)告涉及Stadler教授及其合作者在RNA基因組學(xué)研究中的最新進(jìn)展。雖然人類基因組DNA已經(jīng)知曉,但大部分區(qū)域的基因組功能卻不明;同時(shí)許多的轉(zhuǎn)錄序列執(zhí)行功能,卻并不翻譯成蛋白質(zhì),因此很有可能基因組中基因的數(shù)目被低估。為在基因組水平研究功能RNA及其它們之間的相互作用,第一步就是發(fā)展通用而可靠的算法去發(fā)掘基因組中的功能RNA,并對(duì)其進(jìn)行分類。Stadler教授及其合作者發(fā)展了RNAz,能對(duì)脊椎動(dòng)物、尾索動(dòng)物以及部分酵母基因組進(jìn)行有效的搜尋;并隨后發(fā)展了RNAmicro對(duì)得到的功能RNA進(jìn)行有效的分類和起源追溯,這奠定了下一步進(jìn)行大規(guī)?;蚪M搜尋和分類的基礎(chǔ)。
1975年出生的Diogo博士1998年在葡萄牙University of Aveiro獲得學(xué)士學(xué)位,2003年在比利時(shí)University of Liege獲得博士學(xué)位。先后在比利時(shí)列日大學(xué),英國(guó)MRC發(fā)育神經(jīng)生物學(xué)研究中心和西班牙國(guó)家自然科學(xué)博物館作博士后研究。目前主要從事魚類功能形態(tài),比較解剖以及進(jìn)化發(fā)育遺傳研究。其已經(jīng)發(fā)表學(xué)術(shù)論文60多篇,并已出版5本有關(guān)魚類系統(tǒng)發(fā)育和比較解剖的書籍。其中在我所作的報(bào)告是Diogo博士近2年來(lái)在輻鰭魚類的比較解剖,系統(tǒng)發(fā)育和進(jìn)化研究方面的最新進(jìn)展。
在水生所期間,Peter F. Stadler教授和Rui Diogo博士還參觀了水生生物博物館和白鱀豚館,并就感興趣的問題諸如硬骨魚類HOX簇演化研究的最新研究進(jìn)展等與我所有關(guān)專家進(jìn)行了交流。
Peter F. Stadler教授
Rui Diogo博士
