深圳理工大學曹罡教授做客水生所創(chuàng)新系列講座

曹罡教授作報告
11月19日上午,深圳理工大學曹罡教授應邀到中國科學院水生生物研究所進行學術交流,并為科研人員和研究生作了題為“Beyond the Hype: A Critical Look at the Dazzling Single-cell Spatial Omics 熱門之外:對炫目單細胞空間組學的冷靜審視”的學術報告。該報告系水生所創(chuàng)新系列講座2025年第8期。報告會由繆煒所長主持。
曹罡教授介紹了單細胞測序技術的前沿方法,剖析了單細胞測序技術和空間轉錄組技術各自的技術要點,并對二者相結合的單細胞空間組學,在原位測序上如何提升分辨率提出了見解,如機器學習的填充、測序過程中選擇Smart Panel等。還介紹了新開發(fā)的多組學原位成對測序技術(Mip-Seq)技術,解釋了如何將組學與成像(如鈣成像和拉曼光譜)相結合的技術原理。對空間組學數(shù)據(jù)的原位驗證方法,也介紹了新型高靈敏高特異多重FISH技術(π-FISH),可實現(xiàn)多種生物分子(DNA、mRNA 、lncRNA、miRNA、rRNA、部分蛋白質和小分子等)的原位特異性檢測,可實現(xiàn)ncRNA及其靶點和互作蛋白的共檢測。進一步,曹教授還介紹了采用FISH技術結合AI、流式細胞術等方法,將單細胞空間組學產生的數(shù)據(jù)應用于遠程診斷的應用原理。報告結束后,曹罡教授就空間多組學與水生所魚、藻等生物研究相關的技術難點,例如多重FISH技術的應用、原位代謝組結合空間轉錄組的應用可能性等,與現(xiàn)場師生進行了熱烈的問答和討論。
曹罡,荷蘭NCMLS中心博士,冷泉港實驗室博士后,深圳理工大學教授,博士生導師。長期從事新興單細胞空間多維組學技術開發(fā)及其在神經系統(tǒng)生物學和精準診斷中的運用研究。獲國家教學二等獎、中華醫(yī)學科技二等獎,國家精品慕課課程,國家一流本科生課程等。近年來以聯(lián)系作者在Nature Genetics,Nature Biomedical Engineering,Neuron,Nature Communications,Science Advances,Nucleic Acids Res,Genome Biology等一流刊物發(fā)表論文多篇。獲批專利12項,并實現(xiàn)產業(yè)轉化,獲批醫(yī)療器械證多項。
